नवोदय विद्यालय योजना की अनूठी विशेषता भारत की संस्कृति और लोगों की विविधता और बहुलता की समझ को बढ़ावा देने के लिए एक विशेष भाषाई क्षेत्र में एक नवोदय विद्यालय से दूसरे विद्यालय में छात्रों का प्रवास है। इस योजना के अनुसार, एक जेएनवी के 30% बच्चों को एक शैक्षणिक वर्ष के लिए कक्षा-IX स्तर पर दूसरे जेएनवी में स्थानांतरित कर दिया जाता है.प्रवासन आम तौर पर हिंदी भाषी और गैर-हिंदी भाषी जिलों के बीच होता है। 1988-89 में केवल 2 जवाहर नवोदय विद्यालयों और 31 प्रवासी छात्रों के साथ एक मामूली शुरुआत से, यह योजना पिछले 28 वर्षों में मजबूती से बढ़ी है, जिससे यह भारत में स्कूली शिक्षा के क्षेत्र में सबसे बड़ी सफलता की कहानियों में से एक बन गई है।