विद्यालय परिसर/भवन को स्वच्छ और स्वच्छ रखने के लिए, स्वीपर सह चौकीदार के 02 स्थायी पद हैं। इन कर्मचारियों को एडमिन ब्लॉक, एकेडमिक ब्लॉक सहित क्लास रूम/लैब/लाइब्रेरी आदि, हॉस्टल, कैंपस, रूफ टॉप आदि को साफ, हाइजेनिक रखने की जिम्मेदारी दी गई है। इसके अलावा, ये 02 कर्मचारी, छात्र भी परिसर को अच्छी तरह से व्यवस्थित रखने में मदद करते हैं। चूंकि जेएनवी मुज़फ्फरनगर का एक बड़ा परिसर है, जिसमें ३० एकड़ जमीन है, मजदूर हम जंगली सकल, झाड़ियों, पेड़ों को काटने आदि की सफाई के लिए भी लगे हुए हैं। यह कार्य सर्पो और अन्य हानिकारक रचनाकारों के खिलाफ छात्रों की सुरक्षा और सुरक्षा सुनिश्चित करने के लिए प्राथमिकता के आधार पर किया जाता है। छात्र और कर्मचारी भी विशेष रूप से माननीय प्रधान मंत्री के स्वच्छता मिशन के तहत योगदान करते हैं।
वर्ष २०२०-२१ :
स्वच्छ भारत अभियान, स्वच्छ भारत और स्वच्छ भारत अभियान के तहत विद्यालय में स्वच्छता अभियान चलाया गया।